MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 22155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021881	CAT	2	6	216748	216753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464223
3502	NC_021881	CTTT	2	8	216798	216805	0 %	75 %	0 %	25 %	526464223
3503	NC_021881	CCA	2	6	216938	216943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464223
3504	NC_021881	ATT	2	6	216973	216978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464223
3505	NC_021881	CTT	2	6	217143	217148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464223
3506	NC_021881	TGC	2	6	217207	217212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464223
3507	NC_021881	CAAAA	2	10	217215	217224	80 %	0 %	0 %	20 %	526464223
3508	NC_021881	CGC	2	6	217250	217255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464223
3509	NC_021881	CTT	2	6	217291	217296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464223
3510	NC_021881	AAC	2	6	217335	217340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464223
3511	NC_021881	ACC	2	6	217354	217359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464223
3512	NC_021881	TTC	2	6	217477	217482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464223
3513	NC_021881	ATT	2	6	217492	217497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464223
3514	NC_021881	TGA	2	6	217509	217514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464799
3515	NC_021881	CTC	2	6	217571	217576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464799
3516	NC_021881	CA	3	6	217581	217586	50 %	0 %	0 %	50 %	526464799
3517	NC_021881	AGA	2	6	217604	217609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464799
3518	NC_021881	CCCA	2	8	217661	217668	25 %	0 %	0 %	75 %	526464799
3519	NC_021881	A	6	6	217708	217713	100 %	0 %	0 %	0 %	526464799
3520	NC_021881	TAT	2	6	217943	217948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464224
3521	NC_021881	CTTCC	2	10	218002	218011	0 %	40 %	0 %	60 %	526464224
3522	NC_021881	TCT	2	6	218034	218039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464224
3523	NC_021881	CAA	2	6	218059	218064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464224
3524	NC_021881	GAAA	2	8	218104	218111	75 %	0 %	25 %	0 %	526464224
3525	NC_021881	AGT	2	6	218134	218139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464224
3526	NC_021881	CTT	2	6	218170	218175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464224
3527	NC_021881	GCA	2	6	218227	218232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464224
3528	NC_021881	CTT	2	6	218346	218351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464224
3529	NC_021881	GCAC	2	8	218855	218862	25 %	0 %	25 %	50 %	526464800
3530	NC_021881	CAT	2	6	218918	218923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464800
3531	NC_021881	CAG	2	6	218938	218943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464800
3532	NC_021881	TCC	2	6	218973	218978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464800
3533	NC_021881	GAT	2	6	218986	218991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464800
3534	NC_021881	TCA	2	6	219049	219054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464800
3535	NC_021881	ACAT	2	8	219133	219140	50 %	25 %	0 %	25 %	526464800
3536	NC_021881	GAT	2	6	219154	219159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464800
3537	NC_021881	ATT	2	6	219187	219192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464800
3538	NC_021881	ACC	2	6	219247	219252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464800
3539	NC_021881	TAG	2	6	219320	219325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464800
3540	NC_021881	TAT	2	6	219383	219388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464800
3541	NC_021881	CT	3	6	219442	219447	0 %	50 %	0 %	50 %	526464800
3542	NC_021881	CA	3	6	219488	219493	50 %	0 %	0 %	50 %	526464800
3543	NC_021881	CGA	2	6	219510	219515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464800
3544	NC_021881	CGC	2	6	219516	219521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526464800
3545	NC_021881	AGA	2	6	219626	219631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464225
3546	NC_021881	GCG	2	6	219723	219728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464225
3547	NC_021881	TA	4	8	219817	219824	50 %	50 %	0 %	0 %	526464225
3548	NC_021881	GA	3	6	219828	219833	50 %	0 %	50 %	0 %	526464225
3549	NC_021881	AAG	2	6	219939	219944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464225
3550	NC_021881	CAG	2	6	220006	220011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464225
3551	NC_021881	TAG	2	6	220090	220095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464225
3552	NC_021881	GTA	2	6	220098	220103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464225
3553	NC_021881	AG	3	6	220108	220113	50 %	0 %	50 %	0 %	526464225
3554	NC_021881	CTTT	2	8	220122	220129	0 %	75 %	0 %	25 %	526464225
3555	NC_021881	GAC	2	6	220173	220178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464225
3556	NC_021881	TC	3	6	220200	220205	0 %	50 %	0 %	50 %	526464225
3557	NC_021881	GGC	2	6	220239	220244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526464225
3558	NC_021881	AGG	2	6	220286	220291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464225
3559	NC_021881	GGCA	2	8	220340	220347	25 %	0 %	50 %	25 %	526464225
3560	NC_021881	TTA	2	6	220516	220521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464225
3561	NC_021881	TTC	2	6	221351	221356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
3562	NC_021881	TGC	2	6	221358	221363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464226
3563	NC_021881	TTC	2	6	221463	221468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
3564	NC_021881	CCT	2	6	221492	221497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464226
3565	NC_021881	TTTTC	2	10	221636	221645	0 %	80 %	0 %	20 %	526464226
3566	NC_021881	GCAATG	2	12	221656	221667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526464226
3567	NC_021881	GCAT	2	8	221725	221732	25 %	25 %	25 %	25 %	526464226
3568	NC_021881	T	8	8	221739	221746	0 %	100 %	0 %	0 %	526464226
3569	NC_021881	ATC	2	6	221901	221906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
3570	NC_021881	ATC	2	6	221908	221913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
3571	NC_021881	TATG	2	8	221919	221926	25 %	50 %	25 %	0 %	526464226
3572	NC_021881	AAAG	2	8	221968	221975	75 %	0 %	25 %	0 %	526464226
3573	NC_021881	CTT	2	6	222014	222019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
3574	NC_021881	AGA	2	6	222053	222058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464226
3575	NC_021881	T	7	7	222068	222074	0 %	100 %	0 %	0 %	526464226
3576	NC_021881	CTC	2	6	222172	222177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464226
3577	NC_021881	AAG	2	6	222206	222211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464226
3578	NC_021881	AGTT	2	8	222236	222243	25 %	50 %	25 %	0 %	526464226
3579	NC_021881	TCT	2	6	222307	222312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
3580	NC_021881	AG	3	6	222347	222352	50 %	0 %	50 %	0 %	526464226
3581	NC_021881	T	6	6	222404	222409	0 %	100 %	0 %	0 %	526464226
3582	NC_021881	GGA	2	6	222544	222549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464226
3583	NC_021881	CCTG	2	8	222630	222637	0 %	25 %	25 %	50 %	526464226
3584	NC_021881	AAG	2	6	222676	222681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464226
3585	NC_021881	GAG	2	6	222742	222747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464226
3586	NC_021881	TTC	2	6	222759	222764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464226
3587	NC_021881	ACT	2	6	222787	222792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
3588	NC_021881	TAG	2	6	222842	222847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464226
3589	NC_021881	ACT	3	9	222985	222993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
3590	NC_021881	ACC	2	6	223005	223010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526464226
3591	NC_021881	TC	3	6	223031	223036	0 %	50 %	0 %	50 %	526464226
3592	NC_021881	GCA	2	6	223087	223092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464226
3593	NC_021881	TCC	2	6	223119	223124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464226
3594	NC_021881	CAA	2	6	223127	223132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464226
3595	NC_021881	CTA	2	6	223133	223138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
3596	NC_021881	CAT	2	6	223139	223144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464226
3597	NC_021881	TTA	2	6	223241	223246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464227
3598	NC_021881	TAT	2	6	223269	223274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526464227
3599	NC_021881	AGG	2	6	223320	223325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464227
3600	NC_021881	GGTA	2	8	223328	223335	25 %	25 %	50 %	0 %	526464227
3601	NC_021881	AGC	2	6	223395	223400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464227
3602	NC_021881	AGG	2	6	223429	223434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526464227
3603	NC_021881	TGA	2	6	223447	223452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464227
3604	NC_021881	ATGCGT	2	12	223467	223478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526464227
3605	NC_021881	TAC	2	6	223566	223571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464227
3606	NC_021881	TGT	2	6	223578	223583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464227
3607	NC_021881	AAC	2	6	223655	223660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464227
3608	NC_021881	GCT	2	6	223727	223732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464227
3609	NC_021881	GCGTT	2	10	223772	223781	0 %	40 %	40 %	20 %	526464227
3610	NC_021881	TGC	2	6	223852	223857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464227
3611	NC_021881	TGA	3	9	223884	223892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464227
3612	NC_021881	TG	3	6	224099	224104	0 %	50 %	50 %	0 %	526464801
3613	NC_021881	AAGA	2	8	224153	224160	75 %	0 %	25 %	0 %	526464801
3614	NC_021881	AGC	2	6	224257	224262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464802
3615	NC_021881	GCAG	2	8	224269	224276	25 %	0 %	50 %	25 %	526464802
3616	NC_021881	ATC	2	6	224277	224282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464802
3617	NC_021881	CAA	2	6	224297	224302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526464802
3618	NC_021881	AAGC	2	8	224373	224380	50 %	0 %	25 %	25 %	526464802
3619	NC_021881	CAT	2	6	225596	225601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464803
3620	NC_021881	ATG	2	6	225602	225607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464803
3621	NC_021881	TGA	2	6	225623	225628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464803
3622	NC_021881	AGA	2	6	225647	225652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526464803
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3624	NC_021881	CTA	2	6	225709	225714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464803
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3986	NC_021881	TCT	2	6	246890	246895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
3987	NC_021881	TGC	2	6	246972	246977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
3988	NC_021881	CGT	2	6	246984	246989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526464240
3989	NC_021881	T	7	7	247001	247007	0 %	100 %	0 %	0 %	526464240
3990	NC_021881	CAT	2	6	247008	247013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
3991	NC_021881	TTC	2	6	247019	247024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526464240
3992	NC_021881	GTT	2	6	247089	247094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
3993	NC_021881	CTA	2	6	247106	247111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526464240
3994	NC_021881	TG	4	8	247112	247119	0 %	50 %	50 %	0 %	526464240
3995	NC_021881	GT	3	6	247143	247148	0 %	50 %	50 %	0 %	526464240
3996	NC_021881	TTG	2	6	247177	247182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526464240
3997	NC_021881	TAG	2	6	247190	247195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526464240
3998	NC_021881	ATGCC	2	10	247331	247340	20 %	20 %	20 %	40 %	526464240
3999	NC_021881	AGC	2	6	247393	247398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526464240
4000	NC_021881	CCT	2	6	247436	247441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526464240

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